我有多个包含此信息的文件:

sP12345.txt

COMMENT     Method: conceptual translation.
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..3024
                     /organism="H"
                     /isolate="sP12345"
                     /isolation_source="blood"
                     /host="Homo sapiens"
                     /db_xref="taxon:11103"
                     /collection_date="31-Mar-2014"
                     /note="genotype: 3"

sP4567.txt

COMMENT     Method: conceptual translation.
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..3024
                     /organism="H"
                     /isolate="sP4567"
                     /isolation_source="blood"
                     /host="Homo sapiens"
                     /db_xref="taxon:11103"
                     /collection_date="31-Mar-2014"
                     /note="genotype: 2"

现在我想获取 /note="genotype: 3" 并仅复制 genotype: 之后的数字，将其复制到新的文本文件并打印文件名已作为第 2 列。

预期输出:

3  sP12345
2  sP4567

我试过这段代码:但它只打印第一列而不是文件名:

awk -F'note="genotype: ' -v OFS='\t' 'FNR==1{++c} NF>1{print $2, c}' *.txt > output_file.txt

最佳答案

您可以使用:

awk '/\/note="genotype: /{gsub(/^.* |"$/, ""); f=FILENAME; sub(/\.[^.]+$/, "", f); print $0 "\t" f}' sP*.txt

3   sP12345
2   sP4567

https://stackoverflow.com/questions/71338798/